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| 長崎県 | 諫早市 | 諫早 | 諫早神社 | 未参拝 | 県社 |
| 長崎県 | 雲仙市 | 諫早・愛野 | 橘神社 | 未参拝 | |
| 長崎県 | 雲仙市 | 諫早・愛野 | 温泉神社 | 未参拝 | 県社 |
| 長崎県 | 雲仙市 | 神代町 | 岩戸神社 | 未参拝 | |
| 長崎県 | 島原市 | 島鉄本社前 | 霊丘神社 | 未参拝 | 県社 |
| 長崎県 | 長崎市 | 諏訪神社前・長崎 | 鎮西大社諏訪神社 | 未参拝 | 国幣中社・別表 |
| 長崎県 | 長崎市 | 新大工町 | 若宮稲荷神社 | 未参拝 | |
| 長崎県 | 長崎市 | 正覚寺下 | 八坂神社 | 未参拝 | |
| 長崎県 | 長崎市 | 大橋 | 長崎縣護國神社 | 未参拝 | 別表・指定護国 |
| 長崎県 | 長崎市 | 長崎 | 淵神社 | 未参拝 | 県社 |
| 長崎県 | 長崎市 | 浦上 | 山王神社 | 未参拝 | 県社 |
| 長崎県 | 大村市 | 大村 | 大村神社 | 未参拝 | 県社 |
| 長崎県 | 佐世保市 | 佐世保・北佐世保 | 亀山八幡宮 | 未参拝 | 県社・別表 |
| 長崎県 | 平戸市 | たびら平戸口 | 亀岡神社 | 未参拝 | 県社 |
| 長崎県 | 平戸市 | たびら平戸口 | 志々伎神社 | 未参拝 | 式内・県社 |
| 長崎県 | 五島市 | 福江島（五島列島） | 城山神社 | 未参拝 | 県社 |
| 長崎県 | 壱岐市 | 壱岐 | 興神社 | 未参拝 | 壱岐国一宮・名神大社・村社・神饌幣帛料供進社 |
| 長崎県 | 壱岐市 | 壱岐 | 総社神社 | 未参拝 | 壱岐国総社 |
| 長崎県 | 壱岐市 | 壱岐 | 天手長男神社 | 未参拝 | 壱岐国一宮・名神大社[論]・村社 |
| 長崎県 | 壱岐市 | 壱岐 | 住吉神社 | 未参拝 | 名神大社・国幣中社・別表 |
| 長崎県 | 壱岐市 | 壱岐 | 本宮八幡神社 | 未参拝 | 名神大社・村社 |
| 長崎県 | 壱岐市 | 壱岐 | 箱崎八幡神社 | 未参拝 | 名神大社・村社 |
| 長崎県 | 壱岐市 | 壱岐 | 聖母宮 | 未参拝 | 壱岐国二宮・名神大社・郷社 |
| 長崎県 | 対馬市 | 対馬 | 厳原八幡宮神社 | 未参拝 | 対馬国一宮・名神大社・県社 |
| 長崎県 | 対馬市 | 対馬 | 多久頭魂神社 | 未参拝 | 名神大社・郷社 |
| 長崎県 | 対馬市 | 対馬 | 小茂田浜神社 | 未参拝 | 県社 |
| 長崎県 | 対馬市 | 対馬 | 鶏知住吉神社 | 未参拝 | 名神大社・県社 |
| 長崎県 | 対馬市 | 対馬 | 太祝詞神社 | 未参拝 | 名神大社・県社 |
| 長崎県 | 対馬市 | 対馬 | 和多都美神社 | 未参拝 | 名神大社・村社 |
| 長崎県 | 対馬市 | 対馬 | 海神神社 | 未参拝 | 対馬国一宮・名神大社・国幣中社・別表 |